13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0778 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0750  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.018724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0791  hypothetical protein  97.92 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4439  hypothetical protein  92.71 
 
 		 96 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4725  hypothetical protein  81.25 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0972  hypothetical protein  71.88 
 
 		 95 aa  136  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5634  hypothetical protein  71.88 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0949  hypothetical protein  70.83 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.698299  normal  0.474864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5291  hypothetical protein  67.71 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61430  hypothetical protein  65.62 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.330544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41340  hypothetical protein  65.96 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0051  hypothetical protein  43.33 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3196  hypothetical protein  38.3 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.125791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>