13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0051 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0051  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  215  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0791  hypothetical protein  45.05 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0750  hypothetical protein  43.96 
 
 
104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.018724  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3196  hypothetical protein  44.68 
 
 
99 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.125791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0778  hypothetical protein  43.96 
 
 
96 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4439  hypothetical protein  46.15 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4725  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0972  hypothetical protein  39.56 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5634  hypothetical protein  38.46 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61430  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.330544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41340  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5291  hypothetical protein  39.56 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0949  hypothetical protein  38.46 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.698299  normal  0.474864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>