22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3793 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3793  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 490 aa  985    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3975  outer membrane efflux protein  97.37 
 
 		 495 aa  932    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3849  outer membrane efflux protein  95.75 
 
 		 495 aa  917    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3343  outer membrane efflux protein  87.58 
 
 		 492 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0516  outer membrane efflux protein  69.28 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3515  outer membrane efflux protein  69.49 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0516  outer membrane efflux family protein, putative  69.43 
 
 		 456 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0518  outer membrane efflux family protein, putative  69.16 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4083  outer membrane efflux family protein, putative  61.21 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0539  outer membrane efflux family protein, putative  60.68 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0476  outer membrane efflux family protein, putative  97 
 
 		 233 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0554  outer membrane efflux family protein, putative  60.52 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0475  outer membrane efflux protein  96.98 
 
 		 232 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3358  outer membrane efflux family protein, putative  56.4 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  28.39 
 
 		 400 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1426  efflux family outer membrane protein  28.16 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2869  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  24.17 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  30.5 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>