23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2624 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  41.38 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0943  hypothetical protein  63.27 
 
 
62 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.654642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  44.64 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  48.98 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  51.02 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  35.71 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  51.22 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  38.46 
 
 
97 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  38.46 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  32.61 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0043  hypothetical protein  51.02 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000220124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  35.42 
 
 
327 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  23.08 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  29.17 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12060  hypothetical protein  26.03 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1472  hypothetical protein  69.57 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3597  hypothetical protein  30.11 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  38.78 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  34.62 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>