19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0943 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0943  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.654642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  63.27 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  57.45 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  68.18 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  61.36 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  42.59 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  52.38 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0043  hypothetical protein  65.12 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000220124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12060  hypothetical protein  33.93 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  37.5 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  40.48 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  45 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  45.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  40.91 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  38 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  37.78 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>