36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0039 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0043  hypothetical protein  89.06 
 
 
64 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000220124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  94.34 
 
 
64 aa  98.6  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  58.18 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  51.02 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0943  hypothetical protein  68.18 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.654642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  57.78 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  48.94 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  51.02 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  51.85 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  40 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  40 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  46.43 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  43.18 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  37.29 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  37.29 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  42 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  37.29 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  37.25 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  37.25 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  36.67 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  39.62 
 
 
119 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  39.13 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2920  hypothetical protein  43.9 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371621  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  38.3 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2536  hypothetical protein  43.9 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361006  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5371  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.059612  normal  0.0608107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3451  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.22431  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4915  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424589  normal  0.380404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4350  hypothetical protein  39.13 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000333846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4866  hypothetical protein  36.96 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  hitchhiker  0.000131644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  44.19 
 
 
193 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12060  hypothetical protein  41.3 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>