23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1540 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  39.22 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  37.25 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  41.38 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  34.72 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  34.72 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  34.72 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  43.75 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  34.74 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  36.07 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  45.65 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1762  immunity protein, putative  38.24 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0454984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  34.48 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  34.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  34.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  34.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  38.18 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>