36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0870 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  96.43 
 
 
112 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  96.43 
 
 
112 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  96.43 
 
 
112 aa  214  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1762  immunity protein, putative  90.74 
 
 
108 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0454984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  73.15 
 
 
108 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4866  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  hitchhiker  0.000131644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4350  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000333846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4915  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424589  normal  0.380404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3451  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.22431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5371  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.059612  normal  0.0608107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  53.19 
 
 
102 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  52.13 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  44.78 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  53.49 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  40.28 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  39.13 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  44.23 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  51.06 
 
 
116 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  41.3 
 
 
107 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0043  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000220124  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  34.72 
 
 
97 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  37.78 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2536  hypothetical protein  36.59 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2920  hypothetical protein  36.59 
 
 
99 aa  43.9  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  36.73 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  40.38 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  35.94 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5164  hypothetical protein  42.55 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  35.42 
 
 
142 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>