14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5164 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5164  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1001  hypothetical protein  69.51 
 
 		 84 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38863  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  43.55 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  40.35 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  42.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  42.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  47.83 
 
 		 108 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2536  hypothetical protein  33.96 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2920  hypothetical protein  33.96 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371621  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  39.34 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  43.75 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>