20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0892 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1459  phage major capsid protein E  98.25 
 
 		 342 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1291  phage major capsid protein E  98.25 
 
 		 342 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0892  phage major capsid protein E  100 
 
 		 342 aa  708    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2810  phage major capsid protein E  87.68 
 
 		 342 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00737  hypothetical protein  61.88 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10041  capsid component  61.88 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1625  phage major capsid protein E  61.58 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0260656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1788  phage major capsid protein E  61.58 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.123536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2096  major capsid protein E  61 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000203332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2223  phage major capsid protein E  54.28 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00397353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1583  phage major capsid protein E  46.65 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01983  hypothetical protein  39.71 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1191  major head protein  94.32 
 
 		 88 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2772  major head protein  94.32 
 
 		 88 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3125  major capsid protein E  26.88 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1654  phage major capsid protein E  27.3 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.203373 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4918  major capsid protein E  24.08 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.532464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1207  hypothetical protein  24.62 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000800275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1065  major head protein  23.05 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.879478  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1446  hypothetical protein  36.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.836351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>