20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2223 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2223  phage major capsid protein E  100 
 
 		 344 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00397353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2096  major capsid protein E  57.65 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000203332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00737  hypothetical protein  57.06 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1788  phage major capsid protein E  57.06 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.123536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1625  phage major capsid protein E  57.06 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0260656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10041  capsid component  57.06 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2810  phage major capsid protein E  54.71 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0892  phage major capsid protein E  54.28 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1291  phage major capsid protein E  53.69 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1459  phage major capsid protein E  53.69 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01983  hypothetical protein  45.66 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1583  phage major capsid protein E  44.51 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3125  major capsid protein E  29.97 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1654  phage major capsid protein E  28.49 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.203373 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4918  major capsid protein E  26.36 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.532464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1207  hypothetical protein  27.67 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000800275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1191  major head protein  54.43 
 
 		 88 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2772  major head protein  54.43 
 
 		 88 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1065  major head protein  28.57 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.879478  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1446  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.836351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>