17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1191 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2772  major head protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1191  major head protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1459  phage major capsid protein E  94.32 
 
 
342 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1291  phage major capsid protein E  94.32 
 
 
342 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0892  phage major capsid protein E  94.32 
 
 
342 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2810  phage major capsid protein E  84.09 
 
 
342 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2096  major capsid protein E  56.63 
 
 
341 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000203332  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00737  hypothetical protein  56.63 
 
 
341 aa  96.7  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10041  capsid component  56.63 
 
 
341 aa  96.7  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1625  phage major capsid protein E  56.63 
 
 
341 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0260656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1788  phage major capsid protein E  56.63 
 
 
341 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.123536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2223  phage major capsid protein E  54.43 
 
 
344 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00397353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1583  phage major capsid protein E  38.82 
 
 
351 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3125  major capsid protein E  34.57 
 
 
348 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01983  hypothetical protein  41.25 
 
 
345 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1654  phage major capsid protein E  31.25 
 
 
343 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.203373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1207  hypothetical protein  38.6 
 
 
330 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000800275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>