34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0385 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  631  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  27.87 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  29.96 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  26.78 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  30.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  27.46 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.79 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  29.38 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  29.52 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  26.64 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  20.08 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  28.65 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  26.54 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  25.26 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  24.89 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  24.89 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  24.89 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25.27 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  27.53 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  26.72 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25.6 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  27.35 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  24.9 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  26.22 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  30 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  26.37 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  21.12 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  26.21 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>