71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1515 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  100 
 
 
350 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000403723  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  50.95 
 
 
311 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  51.06 
 
 
335 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  unclonable  0.00000127891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  49.87 
 
 
344 aa  324  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  53.17 
 
 
336 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  50.27 
 
 
364 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000481866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  50 
 
 
368 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000875421  decreased coverage  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  48.95 
 
 
342 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000198089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  50.8 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  50.8 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000277167  hitchhiker  0.0000636327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  49.45 
 
 
346 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000182258  decreased coverage  0.000000000692006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  49.45 
 
 
346 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000216303  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  49.73 
 
 
341 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000116283  hitchhiker  0.00000000149042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  49.58 
 
 
346 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509277  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  47.24 
 
 
325 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  47.15 
 
 
352 aa  292  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  36.52 
 
 
328 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  36.52 
 
 
328 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  36.52 
 
 
327 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  35.9 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  35.11 
 
 
340 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  35.49 
 
 
332 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  34.57 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  33.05 
 
 
318 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000114957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  34.02 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  44.13 
 
 
532 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  46.58 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  32.13 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  28.85 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  45.74 
 
 
317 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  31.25 
 
 
291 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  42.11 
 
 
332 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  42.11 
 
 
332 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  29.09 
 
 
308 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  34.88 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  39.44 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  34.65 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  33.77 
 
 
289 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  40.56 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  44.19 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  37.41 
 
 
317 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  41.04 
 
 
288 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  41.04 
 
 
287 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  37.14 
 
 
225 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  37.14 
 
 
230 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  39.55 
 
 
296 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  38.51 
 
 
288 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  39.55 
 
 
297 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  39.55 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  41.18 
 
 
291 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  40.77 
 
 
342 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  36.57 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  24.65 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  41.03 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  37.17 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  36.59 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  31.06 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  37.17 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  30.07 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  32.39 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  33.33 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  32.52 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  25.93 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  30.29 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  29.41 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  33.58 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  31.01 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  30.23 
 
 
243 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  30.23 
 
 
243 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  30.89 
 
 
441 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  35.21 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>