88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1593 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  100 
 
 
297 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  98.32 
 
 
317 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  95.62 
 
 
296 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  91.28 
 
 
294 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  78.86 
 
 
288 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  78.19 
 
 
287 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  76.77 
 
 
288 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  68.08 
 
 
290 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  67.87 
 
 
289 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  66.67 
 
 
273 aa  348  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  62.21 
 
 
285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  35.55 
 
 
342 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  48.05 
 
 
378 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  53.19 
 
 
423 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  50 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  43.97 
 
 
444 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  38.05 
 
 
532 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  44.3 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  30.67 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  30.93 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  unclonable  0.00000127891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  30.87 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  32.23 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  31.78 
 
 
318 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000114957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  44.62 
 
 
336 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  33.23 
 
 
328 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  33.23 
 
 
328 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  33.23 
 
 
327 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  43.06 
 
 
332 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  43.28 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000116283  hitchhiker  0.00000000149042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  42.25 
 
 
291 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  30.35 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  41.96 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  39.26 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  43.08 
 
 
311 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  35.5 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  41.48 
 
 
298 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  36.54 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000403723  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  33.33 
 
 
346 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000182258  decreased coverage  0.000000000692006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  32.91 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000216303  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  39.23 
 
 
336 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  32.03 
 
 
368 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000875421  decreased coverage  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  32.22 
 
 
356 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000277167  hitchhiker  0.0000636327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  32.22 
 
 
356 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  39.01 
 
 
352 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  32.03 
 
 
364 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000481866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  40 
 
 
344 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  37.31 
 
 
230 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  37.31 
 
 
225 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  36.31 
 
 
342 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000198089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  40.31 
 
 
346 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509277  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  39.72 
 
 
328 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000442866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  40.15 
 
 
328 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000023932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  40.15 
 
 
328 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  40.15 
 
 
328 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000505214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  40.15 
 
 
328 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000146198  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  40.14 
 
 
267 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  37.31 
 
 
317 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  39.37 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000846548  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000911583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7392099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  35.9 
 
 
365 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  36.77 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000420135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  37.31 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  38.39 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  33.08 
 
 
395 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  35.51 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  37.69 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  33.33 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  31.16 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  31.16 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  30.88 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  30.71 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.54 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  30.16 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  30.58 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  26.79 
 
 
441 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1240  cell division protein-like  25.81 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  31.3 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  29.2 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  25.4 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  32.04 
 
 
438 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>