83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2897 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  100 
 
 		 344 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  86.61 
 
 		 346 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000182258  decreased coverage  0.000000000692006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  86.32 
 
 		 346 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000216303  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  85.47 
 
 		 346 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509277  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  73.91 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000481866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  72.85 
 
 		 368 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000875421  decreased coverage  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  75.77 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000198089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  73.42 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  73.42 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000277167  hitchhiker  0.0000636327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  55.3 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  51.87 
 
 		 335 aa  338  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  unclonable  0.00000127891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  48.75 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000403723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  50.94 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000116283  hitchhiker  0.00000000149042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  50.13 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  50.99 
 
 		 325 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  49.45 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  37.11 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  37.11 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  37.11 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  35.51 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000114957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  36.63 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  35.09 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  33.99 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  34.94 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  34.13 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  34.13 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000846548  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  33.94 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000264058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  33.94 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  33.94 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7392099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  33.94 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000911583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  33.03 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  33.03 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  53.44 
 
 		 532 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  33.11 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  51.94 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  30.95 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  29.71 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  44.67 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000420135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  47.26 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  50.39 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000023932  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  27.68 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  50.39 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000505214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  50.39 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  50.39 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  48.06 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  29.75 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  51.33 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  37.7 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  28.81 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  49.58 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  40.28 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  36.97 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  42.64 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  41.09 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  36.97 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  42.64 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  42.64 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  39.73 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  41.09 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  40.28 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  40.31 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  39.86 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  40.31 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  34.62 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  25.36 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  38.05 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  32.56 
 
 		 259 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  32.6 
 
 		 259 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  30.57 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  37.61 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  24.47 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  37.88 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  35.04 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  34.19 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  33.33 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  33.33 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  33.9 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  33.9 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  27.41 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  25.21 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  32.2 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  29.29 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25.64 
 
 		 441 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>