20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2243 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2243  sphingosine kinase  100 
 
 
276 aa  547  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849968  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3322  hypothetical protein  37.64 
 
 
283 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  33.88 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2335  diacylglycerol kinase catalytic region  31.73 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.196294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0427  ATP-NAD/AcoX kinase  24.63 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  33.99 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0084  diacylglycerol kinase catalytic region  29.91 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0847561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  34.65 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  33.99 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  31.88 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  28.91 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  28.37 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0876  diacylglycerol kinase catalytic subunit  35.71 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.742503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  31.63 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  27.66 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  29.21 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  34.62 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 
291 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  22.56 
 
 
320 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  36 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>