34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1638 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1638  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  472  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
136 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  31.76 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0451  hypothetical protein  25.64 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00575582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0822  thioredoxin, putative  31.76 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.678614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0671  thioredoxin domain-containing protein  28.26 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0813  thioredoxin  27 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4521  thioredoxin  24.44 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0370852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0828  putative thioredoxin  31.76 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7466400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0659  thioredoxin  31.76 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0671  thioredoxin  31.76 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  30.59 
 
 
104 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0118  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00137916  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0179  hypothetical protein  29.49 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0757  thioredoxin  30.59 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0721  thioredoxin  30.59 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  32.35 
 
 
107 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0180  hypothetical protein  29.49 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000228172  hitchhiker  3.99309e-36 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  30.77 
 
 
104 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5533  thioredoxin domain-containing protein  31.08 
 
 
138 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28 
 
 
109 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  27.27 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  27.27 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0014  hypothetical protein  26.85 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.106983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  31.58 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  30.26 
 
 
104 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  31.58 
 
 
144 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  27.01 
 
 
286 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  26.74 
 
 
106 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  27.62 
 
 
107 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  31.08 
 
 
144 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1040  Thioredoxin domain protein  22.77 
 
 
167 aa  42  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  30.26 
 
 
144 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  30.88 
 
 
107 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>