17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0185 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0185  transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.159046  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0068  hypothetical protein  80 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0182  putative transcriptional regulator  78.75 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1993  putative transcriptional regulator  78.75 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1912  helix-turn-helix domain-containing protein  51.69 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3446  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1541  transcriptional regulator, XRE family  53.75 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0274839  hitchhiker  0.00170157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1676  XRE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3607  conserved hypothetical protein  68.42 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4940  hypothetical protein  68.42 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.723559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5905  hypothetical protein  65.79 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4626  hypothetical protein  71.88 
 
 		 49 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4938  hypothetical protein  68.75 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  42.62 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0605  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>