12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1171 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0812  putative bacteriophage protein  90.68 
 
 		 354 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1171  putative bacteriophage protein  100 
 
 		 355 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2248  hypothetical protein  34.57 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1808  hypothetical protein  31.16 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00319764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2406  hypothetical protein  31.23 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3086  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1987  hypothetical protein  26.65 
 
 		 322 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1288  hypothetical protein  26.44 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1257  hypothetical protein  26.82 
 
 		 276 aa  89.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1020  hypothetical protein  26.82 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.673625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22110  hypothetical protein  21.73 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302084  unclonable  4.28855e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>