15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2406 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2406  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1808  hypothetical protein  57.62 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2248  hypothetical protein  47.65 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3086  hypothetical protein  41.61 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3648  hypothetical protein  41.91 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00319764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1987  hypothetical protein  35.36 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0812  putative bacteriophage protein  30.41 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1171  putative bacteriophage protein  31.23 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1288  hypothetical protein  34.03 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1020  hypothetical protein  33.61 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.673625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1257  hypothetical protein  33.61 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0852  hypothetical protein  26.48 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0138661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2203  hypothetical protein  22.07 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0871  hypothetical protein  21.57 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3481  hypothetical protein  20.43 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000172273  normal  0.0268237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>