18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1288 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1288  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1020  hypothetical protein  98.91 
 
 
276 aa  556  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.673625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1257  hypothetical protein  96.74 
 
 
276 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1808  hypothetical protein  31.77 
 
 
322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323133  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3086  hypothetical protein  28.91 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2406  hypothetical protein  34.03 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2248  hypothetical protein  27.78 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.332155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0812  putative bacteriophage protein  27.59 
 
 
354 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1171  putative bacteriophage protein  26.44 
 
 
355 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3648  hypothetical protein  30.08 
 
 
326 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00319764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1987  hypothetical protein  28.1 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22110  hypothetical protein  24.3 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302084  unclonable  4.28855e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3481  hypothetical protein  24.83 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000172273  normal  0.0268237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0871  hypothetical protein  24.65 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1239  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2936  hypothetical protein  25.39 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2823  hypothetical protein  23.16 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0852  hypothetical protein  22.22 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0138661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>