14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2248 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2406  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1808  hypothetical protein  43 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3086  hypothetical protein  42.48 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3648  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00319764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1171  putative bacteriophage protein  34.57 
 
 		 355 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0812  putative bacteriophage protein  34.02 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1987  hypothetical protein  32.48 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1257  hypothetical protein  28.47 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1020  hypothetical protein  28.12 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.673625  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1288  hypothetical protein  27.78 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0852  hypothetical protein  24.54 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0138661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3481  hypothetical protein  21.56 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000172273  normal  0.0268237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22110  hypothetical protein  22.31 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302084  unclonable  4.28855e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>