26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2219 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  98.52 
 
 		 675 bp  1251    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  98.81 
 
 		 675 bp  1267    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  95.7 
 
 		 675 bp  1100    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  87.96 
 
 		 666 bp  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  97.56 
 
 		 675 bp  1166    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  97.56 
 
 		 675 bp  1166    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  98.81 
 
 		 675 bp  1267    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  97.56 
 
 		 675 bp  1166    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  97.56 
 
 		 675 bp  1166    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  95.7 
 
 		 675 bp  1100    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  87.96 
 
 		 666 bp  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0032    96.89 
 
 		 675 bp  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195097  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  97.07 
 
 		 627 bp  1066    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  98.67 
 
 		 675 bp  1259    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  98.52 
 
 		 675 bp  1251    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  97.38 
 
 		 645 bp  1076    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  98.81 
 
 		 675 bp  1267    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2219    100 
 
 		 674 bp  1336    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1588  IS431mec-like transposase  98.96 
 
 		 423 bp  729    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  96.89 
 
 		 675 bp  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1583  IS431mec-like transposase  98.03 
 
 		 324 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  87.1 
 
 		 681 bp  60  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  87.1 
 
 		 681 bp  60  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  87.1 
 
 		 681 bp  60  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  87.1 
 
 		 681 bp  60  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  86.79 
 
 		 495 bp  50.1  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>