25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2483 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2483  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1779  hypothetical protein  39.2 
 
 
332 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1295  hypothetical protein  36.24 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0370  hypothetical protein  33.22 
 
 
350 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146406  unclonable  0.0000143605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0193  hypothetical protein  32.78 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1350  hypothetical protein  34.01 
 
 
323 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0747  hypothetical protein  31.33 
 
 
305 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2514  hypothetical protein  28.89 
 
 
313 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.25837  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5080  hypothetical protein  27.44 
 
 
319 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0568  hypothetical protein  29.14 
 
 
325 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.937151  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2802  hypothetical protein  31.71 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262309  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2838  conserved hypothetical cytosolic protein  31.73 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.445341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3302  hypothetical protein  30.37 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1869  hypothetical protein  30.89 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1983  conserved hypothetical cytosolic protein  26.73 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00299228  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1432  hypothetical protein  27.12 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2062  hypothetical protein  28.85 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1257  conserved hypothetical cytosolic protein  27.76 
 
 
332 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3261  hypothetical protein  25.6 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3253  hypothetical protein  24.04 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1179  hypothetical protein  26.45 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0632  hypothetical protein  29.21 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1011  hypothetical protein  25.87 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3249  hypothetical protein  26.11 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2394  hypothetical protein  22.12 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>