27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1432 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1432  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  634    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0370  hypothetical protein  35.76 
 
 
350 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146406  unclonable  0.0000143605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0193  hypothetical protein  36.94 
 
 
329 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1295  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1779  hypothetical protein  28.96 
 
 
332 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1983  conserved hypothetical cytosolic protein  28.26 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00299228  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2062  hypothetical protein  29.08 
 
 
333 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0568  hypothetical protein  28.3 
 
 
325 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.937151  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2802  hypothetical protein  31.12 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0747  hypothetical protein  27 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2483  hypothetical protein  27.12 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1257  conserved hypothetical cytosolic protein  27.71 
 
 
332 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114914 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2838  conserved hypothetical cytosolic protein  26.88 
 
 
329 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.445341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3302  hypothetical protein  28.35 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1869  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3261  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2514  hypothetical protein  27.21 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.25837  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5080  hypothetical protein  25.79 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1350  hypothetical protein  26.32 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2394  hypothetical protein  25.86 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3253  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1179  hypothetical protein  27.62 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2211  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0632  hypothetical protein  25.42 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2056  hypothetical protein  26 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1011  hypothetical protein  26.4 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3249  hypothetical protein  25.81 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>