27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2062 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2062  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1983  conserved hypothetical cytosolic protein  63.19 
 
 
332 aa  441  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00299228  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1257  conserved hypothetical cytosolic protein  63.89 
 
 
332 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1295  hypothetical protein  35.65 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0747  hypothetical protein  35.76 
 
 
305 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1350  hypothetical protein  36.81 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3261  hypothetical protein  33.44 
 
 
307 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1779  hypothetical protein  33.54 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0370  hypothetical protein  34.18 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146406  unclonable  0.0000143605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0193  hypothetical protein  32.38 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2514  hypothetical protein  28.96 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.25837  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5080  hypothetical protein  30.65 
 
 
319 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1432  hypothetical protein  29.08 
 
 
311 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2483  hypothetical protein  28.85 
 
 
312 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2838  conserved hypothetical cytosolic protein  28.65 
 
 
329 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.445341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1869  hypothetical protein  29.75 
 
 
319 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3302  hypothetical protein  27.69 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2802  hypothetical protein  28.86 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0568  hypothetical protein  26.48 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.937151  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3253  hypothetical protein  27.42 
 
 
317 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0632  hypothetical protein  24.14 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1179  hypothetical protein  27.96 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2394  hypothetical protein  25.15 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3249  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1011  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2056  hypothetical protein  21.36 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2211  hypothetical protein  25.46 
 
 
289 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>