154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2281 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2281  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  226  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  45.71 
 
 
414 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  58.33 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  56.25 
 
 
415 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  56.25 
 
 
406 aa  53.9  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  56.25 
 
 
418 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  56.25 
 
 
390 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  56.52 
 
 
415 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  56.52 
 
 
415 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  52.08 
 
 
419 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  54.17 
 
 
411 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  52.08 
 
 
419 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  52.08 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  52.08 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  52.08 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  52.08 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  52.08 
 
 
436 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  46.38 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  52.08 
 
 
419 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  54.17 
 
 
415 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  54.17 
 
 
415 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  54.17 
 
 
415 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  54.17 
 
 
416 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  54.17 
 
 
416 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0323  transposase, mutator type  45.83 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0965  transposase, mutator type  45.83 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0913563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1067  transposase, mutator type  45.83 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  54.17 
 
 
428 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  54.17 
 
 
416 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  54.17 
 
 
416 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  54.17 
 
 
428 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  54.17 
 
 
428 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  54.17 
 
 
428 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  41.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  41.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  50 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  50 
 
 
413 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  50 
 
 
413 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  41.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  41.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  41.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  46.88 
 
 
399 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  46.88 
 
 
399 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  48.33 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  48.33 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0189  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000475944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1166  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1810  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2280  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2283  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2614  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5729  transposase mutator type  46 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326767  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  48.33 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  48.33 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0637  transposase, mutator type  43.75 
 
 
374 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.270397  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  46.15 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  46.15 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  46.15 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  46.88 
 
 
399 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  46.88 
 
 
399 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  46.88 
 
 
399 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>