14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0328 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0328  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  300  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1195  hypothetical protein  36.9 
 
 
360 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.835277  normal  0.761457 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1238  hypothetical protein  33.87 
 
 
250 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2661  hypothetical protein  44 
 
 
348 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0450  hypothetical protein  42.42 
 
 
279 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0642  hypothetical protein  35.21 
 
 
132 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3813  hypothetical protein  27.89 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.700394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2501  hypothetical protein  35.71 
 
 
342 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2795  hypothetical protein  31.94 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1129  hypothetical protein  41.27 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11170  hypothetical protein  33.75 
 
 
188 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.358256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  34.21 
 
 
331 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4579  hypothetical protein  20.99 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0754  hypothetical protein  34.85 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.542141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>