14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1195 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1195  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  706    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.835277  normal  0.761457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2501  hypothetical protein  29.15 
 
 
342 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2661  hypothetical protein  29.66 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0328  hypothetical protein  38.27 
 
 
159 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1129  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2795  hypothetical protein  39.13 
 
 
165 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0760  hypothetical protein  32.69 
 
 
165 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.429427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0450  hypothetical protein  36.62 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0642  hypothetical protein  34.92 
 
 
132 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23490  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0791  hypothetical protein  31.18 
 
 
172 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.543566  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  34.67 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0069  hypothetical protein  35.59 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.407195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1329  hypothetical protein  22.79 
 
 
160 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>