13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2661 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2661  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  691    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2501  hypothetical protein  49.11 
 
 
342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1195  hypothetical protein  30.51 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.835277  normal  0.761457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0760  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.429427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0328  hypothetical protein  44 
 
 
159 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0791  hypothetical protein  29.13 
 
 
172 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.543566  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2795  hypothetical protein  36.21 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0069  hypothetical protein  29.9 
 
 
282 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.407195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1129  hypothetical protein  29.9 
 
 
155 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0876  hypothetical protein  29.91 
 
 
159 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0642  hypothetical protein  31.33 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23490  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>