21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1443 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1443  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2209  hypothetical protein  50.2 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.911085  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0053  hypothetical protein  46.15 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1235  hypothetical protein  34.46 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.1753 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1123  hypothetical protein  24.74 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1350  hypothetical protein  30.87 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3183  putative O-methyltransferase  28.92 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  34.15 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3499  O-methyltransferase family protein  42.11 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4857  O-methyltransferase family protein  32.26 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3883  O-methyltransferase family 3  28.1 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0913  O-methyltransferase  30.65 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2678  hypothetical protein  29.53 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4690  O-methyltransferase family protein  29.84 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0886  O-methyltransferase family 3  30.89 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0398072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3394  O-methyltransferase family protein  28.29 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219143  normal  0.0356086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0962  O-methyltransferase family protein  26.45 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4360  O-methyltransferase family 3  35.87 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1914  hypothetical protein  32.11 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2526  O-methyltransferase family 3  28.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>