14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0527 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0527  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  283  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.653051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  38.35 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  36.09 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  36.09 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  35.34 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  35.34 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  36.43 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  36.09 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  35.34 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  34.07 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  35.34 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  35.34 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  34.59 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  36.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>