27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3670 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  100 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  97.84 
 
 		 141 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  89.93 
 
 		 139 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  90.51 
 
 		 142 aa  247  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  87.77 
 
 		 139 aa  246  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  87.05 
 
 		 139 aa  239  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  85.4 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  63.43 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  64.93 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  63.85 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  63.85 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  63.85 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3948  flagellar export protein FliJ  66.42 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0169754  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0268  hypothetical protein  60 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3489  flagellar export FliJ  56.56 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0999561  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  50.38 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2528  hypothetical protein  61.17 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3078  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_004310  BR1600  hypothetical protein  51.79 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1543  hypothetical protein  51.79 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3335  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2214  hypothetical protein  54.13 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2604  hypothetical protein  48.62 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3526  hypothetical protein  56.99 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1568  hypothetical protein  52.68 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1018  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.5317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0671  hypothetical protein  38.52 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>