27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6531 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  100 
 
 
139 aa  274  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  89.21 
 
 
139 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  87.77 
 
 
141 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  87.77 
 
 
139 aa  246  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  87.05 
 
 
139 aa  243  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  87.5 
 
 
142 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  85.29 
 
 
141 aa  218  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  66.42 
 
 
135 aa  177  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  70.9 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  66.42 
 
 
134 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  66.42 
 
 
134 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  66.42 
 
 
134 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3948  flagellar export protein FliJ  70.15 
 
 
135 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0169754  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0268  hypothetical protein  56.41 
 
 
133 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  50.38 
 
 
136 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3489  flagellar export FliJ  54.05 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0999561  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_004310  BR1600  hypothetical protein  54.13 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1543  hypothetical protein  54.13 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3078  hypothetical protein  51.38 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2528  hypothetical protein  59.22 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3335  hypothetical protein  51.38 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2214  hypothetical protein  53.21 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2604  hypothetical protein  50.46 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1568  hypothetical protein  53.57 
 
 
141 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3526  hypothetical protein  53.26 
 
 
116 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1018  hypothetical protein  39.2 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.5317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0671  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>