27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2176 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
136 aa  263  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  51.15 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  51.91 
 
 
139 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  50.38 
 
 
139 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  51.15 
 
 
142 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  53.44 
 
 
139 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  50.38 
 
 
139 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  43.94 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  50.94 
 
 
134 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  50.94 
 
 
134 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  50.94 
 
 
134 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1543  hypothetical protein  48.31 
 
 
130 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1600  hypothetical protein  48.31 
 
 
130 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3078  hypothetical protein  47.47 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3335  hypothetical protein  47.47 
 
 
116 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  43.94 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3526  hypothetical protein  48.86 
 
 
116 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1568  hypothetical protein  52.56 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3948  flagellar export protein FliJ  41.98 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0169754  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1018  hypothetical protein  43.93 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.5317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2604  hypothetical protein  47.73 
 
 
116 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2214  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0268  hypothetical protein  38.18 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0671  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3489  flagellar export FliJ  40.86 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0999561  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2528  hypothetical protein  44.55 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>