28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0782 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
134 aa  257  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
134 aa  257  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  99.25 
 
 
134 aa  256  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  85.19 
 
 
135 aa  217  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  85.19 
 
 
135 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  66.42 
 
 
139 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  64.62 
 
 
141 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  64.18 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  63.85 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  63.43 
 
 
142 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  65.67 
 
 
139 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3948  flagellar export protein FliJ  82.96 
 
 
135 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0169754  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  64.62 
 
 
141 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0268  hypothetical protein  57.26 
 
 
133 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  49.24 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2214  hypothetical protein  55.05 
 
 
122 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3489  flagellar export FliJ  56.31 
 
 
131 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0999561  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_004310  BR1600  hypothetical protein  51.38 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1543  hypothetical protein  51.38 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2528  hypothetical protein  60.4 
 
 
134 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3078  hypothetical protein  46.43 
 
 
116 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3526  hypothetical protein  54.76 
 
 
116 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3335  hypothetical protein  52.38 
 
 
116 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2604  hypothetical protein  45.87 
 
 
116 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1568  hypothetical protein  48.39 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1018  hypothetical protein  39.2 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.5317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0671  hypothetical protein  34.38 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0527  hypothetical protein  35.34 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.653051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>