80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3133 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  100 
 
 		 123 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  57.38 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  60.75 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.13 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  56.1 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  56.1 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  55.65 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.84 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  54.78 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  52.63 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.13 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  57.45 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.36 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.28 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.13 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.13 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.81 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.06 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.08 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.08 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.24 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.08 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.8 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  41.88 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  40 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.2 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.24 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.98 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.71 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.67 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.09 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.18 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.27 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  48.84 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.57 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.56 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  37.89 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  45.45 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.78 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.75 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.73 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.46 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.19 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  35.45 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  41.57 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  41.57 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.65 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.55 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.76 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  34.34 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.34 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  43.96 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.36 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  42.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  37.93 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.41 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.41 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0532  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.02 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.947348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.58 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.02 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1428  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.64 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.57 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.56 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5157  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.84 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.52 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.93 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00245075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.9 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3663  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhG subunit-like protein  32.29 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.468328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1746  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.83 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.71 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.71 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3224  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.11 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  26.23 
 
 		 129 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.82 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0864  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.18 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.74172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  28.26 
 
 		 112 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>