91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3476 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  100 
 
 
126 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  94.44 
 
 
126 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  77.19 
 
 
120 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  73.45 
 
 
121 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  72.57 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  75.23 
 
 
121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  73.45 
 
 
121 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.08 
 
 
118 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  48.7 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.27 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.88 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.96 
 
 
118 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  42.24 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  42.02 
 
 
132 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.17 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.25 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.53 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.46 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.46 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.27 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  42.86 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  42.86 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.32 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.75 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.83 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.27 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.83 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.01 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.71 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.2 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.3 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.88 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  45.69 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.65 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  46.15 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  37.86 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.46 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.96 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.26 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.75 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.27 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.78 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.56 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.68 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.67 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.64 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.86 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.89 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.3 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.25 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  35.56 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  34.44 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.44 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.36 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000161563  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.05 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  34.41 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3689  Na+/H+ antiporter subunit  36.67 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.09 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0880  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.23 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0028264  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  33.93 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.83 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1278  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.5 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.49 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  25 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  25 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.21 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.76 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0895  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.57 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107177  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0566  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.33 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.76 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.46 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  38.67 
 
 
116 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.06 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.74 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00245075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0499  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0754  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.46 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0542751  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2928  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.04 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000165861  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1746  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.06 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.81 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.35 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108043  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000413  na+/H+ antiporter subunit G  32.94 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1428  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.26 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.35 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3655  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.39 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.46 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>