77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1005 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 		 119 aa  233  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  81.36 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  48.7 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  55.28 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  51.35 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  46.73 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  47.83 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.71 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.71 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  44.34 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.93 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.76 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.53 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  48.35 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.12 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.25 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.55 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.25 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.15 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.55 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  49.44 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  42.45 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.51 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  41.12 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  51.72 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40.57 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.42 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  43.96 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.82 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.83 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.14 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.32 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.62 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  48.72 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.29 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.89 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.87 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.37 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.45 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.79 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.86 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  41.03 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.77 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.49 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.51 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.3 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  46.88 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.6 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  37.23 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.61 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  44.44 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  44.44 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.14 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  35.14 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  32.35 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  34 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.94 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.94 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.67 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.63 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0532  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.98 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.947348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.1 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14800  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.92 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0754  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.68 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0542751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0566  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.8 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  26.14 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  33 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  29.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.68 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.12 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3655  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.07 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.41 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1746  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.05 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>