73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3620 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 
126 aa  247  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  78.4 
 
 
148 aa  197  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  78.4 
 
 
148 aa  197  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  52.73 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  68.42 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  56.19 
 
 
122 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  57.38 
 
 
123 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  46.72 
 
 
123 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  52.78 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.72 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  52.78 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.36 
 
 
130 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  49.09 
 
 
119 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  45.95 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.25 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.25 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.14 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.29 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.53 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.61 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.28 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.81 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.44 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.05 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.45 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.32 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.22 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  37.72 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.27 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  33.91 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  37 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.44 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  45.45 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.64 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.65 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.79 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.89 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.67 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.96 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.36 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.11 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.89 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.04 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.27 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.82 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  35.16 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.16 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  39.39 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  37.11 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  35.9 
 
 
122 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  35.9 
 
 
122 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  35.23 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.11 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.77 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.59 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  38.2 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.37 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.69 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  32.11 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.88 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  32.69 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.88 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.68 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.71 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.08 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000161563  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.07 
 
 
113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.09 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.33 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0532  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.57 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.947348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  25.26 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.25 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>