74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3710 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3444  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 
148 aa  287  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  0.147499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 
148 aa  287  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  78.4 
 
 
126 aa  197  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0436833  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3536  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  53.1 
 
 
117 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5263  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.24 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1284  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  66.32 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3133  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  56.1 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2811  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  50.45 
 
 
123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.33 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0505  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50.44 
 
 
120 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0440  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50.44 
 
 
120 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2440  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  46.43 
 
 
118 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2659  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  52.04 
 
 
119 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4611  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.14 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0113493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5151  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.14 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5076  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.14 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3515  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.66 
 
 
121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2225  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.69 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1848  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.69 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.657682  normal  0.0378656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.71 
 
 
119 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3315  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.79 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3476  potassium efflux system protein PhaG  38.46 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.84 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.28 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.82 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3257  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.6 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.325283  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  43.33 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3448  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  42.98 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.5 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.94 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.54 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.58 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.53 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.64 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.71 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.78 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.04 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.73 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  35.48 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.37 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.36 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.04 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3904  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40.16 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.96 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.67 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2657  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.2 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0997  pH adaption potassium efflux system, PhaG subunit  32.2 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  46.97 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.94 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1586  Na+/H+ antiporter subunit  38.46 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.8 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0227  Na+/H+ antiporter subunit  32.26 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0138139  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1683  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.67 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4734  Na+/H+ antiporter subunit  34.4 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1519  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.44 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00644946  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2479  Na+/H+ antiporter subunit  32.22 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.49642  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1381  Na+/H+ antiporter subunit  32.22 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3294  Na+/H+ antiporter subunit  35.23 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.2 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.23 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.03 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0965  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.76 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0808525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0946  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.76 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0532  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.12 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.947348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  32.63 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.17 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3142  Na+/H+ antiporter subunit  29.13 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.07 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.63 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0566  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.5 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3224  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.9 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  28.43 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  21.74 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>