10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2129 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3451  hypothetical protein  80.3 
 
 		 466 aa  779    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2000  hypothetical protein  78.8 
 
 		 466 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  942    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0876375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1833  hypothetical protein  65.38 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000567311  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1436  hypothetical protein  63.6 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1190  hypothetical protein  61.24 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3069  hypothetical protein  58.54 
 
 		 489 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0513  hypothetical protein  26.88 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0933  hypothetical protein  25.85 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0938  hypothetical protein  21.45 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.511729  normal  0.150478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>