10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2000 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3451  hypothetical protein  90.13 
 
 		 466 aa  860    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1833  hypothetical protein  66.6 
 
 		 467 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000567311  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2129  hypothetical protein  78.8 
 
 		 467 aa  767    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0876375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1436  hypothetical protein  61.37 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3069  hypothetical protein  58.25 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1190  hypothetical protein  58.8 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0513  hypothetical protein  28.74 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0933  hypothetical protein  26.32 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0938  hypothetical protein  22.82 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.511729  normal  0.150478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>