10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1833 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3451  hypothetical protein  66.17 
 
 		 466 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000567311  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2000  hypothetical protein  66.6 
 
 		 466 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2129  hypothetical protein  65.38 
 
 		 467 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0876375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1436  hypothetical protein  67.45 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3069  hypothetical protein  62.2 
 
 		 489 aa  591  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1190  hypothetical protein  64.32 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0513  hypothetical protein  28.2 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0933  hypothetical protein  25.49 
 
 		 473 aa  94  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0938  hypothetical protein  24.55 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.511729  normal  0.150478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>