11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0933 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1833  hypothetical protein  25.49 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000567311  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2129  hypothetical protein  26.55 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0876375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2000  hypothetical protein  26.63 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3451  hypothetical protein  26.25 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0938  hypothetical protein  25.53 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.511729  normal  0.150478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1436  hypothetical protein  26.24 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1190  hypothetical protein  25.64 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3894  hypothetical protein  26.35 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0513  hypothetical protein  24.14 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.170989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>