14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0322 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0322  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1242    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.119034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0864  hypothetical protein  69.32 
 
 
629 aa  843    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1670  hypothetical protein  32.44 
 
 
628 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3229  hypothetical protein  30.29 
 
 
780 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1724  hypothetical protein  24.82 
 
 
819 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1742  hypothetical protein  26.34 
 
 
665 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3145  hypothetical protein  27.4 
 
 
628 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0426  hypothetical protein  24.35 
 
 
769 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2044  hypothetical protein  25.49 
 
 
664 aa  94.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.698602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1780  hypothetical protein  22.4 
 
 
754 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000305856  normal  0.793864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1355  hypothetical protein  25.36 
 
 
784 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0264494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2568  hypothetical protein  25.89 
 
 
758 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3516  hypothetical protein  20.25 
 
 
921 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0255  hypothetical protein  28.39 
 
 
784 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.86581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>