14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1355 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1355  hypothetical protein  100 
 
 
784 aa  1590    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0264494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1780  hypothetical protein  33.01 
 
 
754 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000305856  normal  0.793864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1724  hypothetical protein  25 
 
 
819 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2044  hypothetical protein  23.06 
 
 
664 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.698602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1742  hypothetical protein  23.97 
 
 
665 aa  94  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3229  hypothetical protein  22.03 
 
 
780 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0322  hypothetical protein  25.55 
 
 
627 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.119034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0864  hypothetical protein  25.13 
 
 
629 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1670  hypothetical protein  23.54 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0426  hypothetical protein  20 
 
 
769 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3145  hypothetical protein  24.41 
 
 
628 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2568  hypothetical protein  21.71 
 
 
758 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3516  hypothetical protein  19.05 
 
 
921 aa  51.2  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0038  hypothetical protein  20.56 
 
 
794 aa  44.3  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>