15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0864 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0322  hypothetical protein  69.32 
 
 
627 aa  847    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.119034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0864  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1236    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1670  hypothetical protein  32.48 
 
 
628 aa  302  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3229  hypothetical protein  31.73 
 
 
780 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1724  hypothetical protein  27 
 
 
819 aa  170  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1742  hypothetical protein  27.27 
 
 
665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3145  hypothetical protein  27.58 
 
 
628 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0426  hypothetical protein  26.52 
 
 
769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2044  hypothetical protein  27.68 
 
 
664 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.698602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1780  hypothetical protein  22.1 
 
 
754 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000305856  normal  0.793864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1355  hypothetical protein  25.13 
 
 
784 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0264494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2568  hypothetical protein  25.47 
 
 
758 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0255  hypothetical protein  28.66 
 
 
784 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.86581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0038  hypothetical protein  20.52 
 
 
794 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3516  hypothetical protein  20.96 
 
 
921 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>