116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2901 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  216  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.649398  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2762  hypothetical protein  92.23 
 
 		 105 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  78.43 
 
 		 103 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6718  protein of unknown function DUF1255  73.27 
 
 		 106 aa  166  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.042876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6412  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  73.79 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1300  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3823  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4545  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593261  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5759  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  71.15 
 
 		 104 aa  164  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3969  hypothetical protein  73.27 
 
 		 106 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.539979  normal  0.0411996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4104  hypothetical protein  73.27 
 
 		 106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4431  hypothetical protein  73.27 
 
 		 106 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1372  hypothetical protein  69.31 
 
 		 106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1207  hypothetical protein  68.93 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2672  protein of unknown function DUF1255  68.93 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1600  hypothetical protein  63.46 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3765  protein of unknown function DUF1255  64.36 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0913  hypothetical protein  65.59 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1857  hypothetical protein  61.39 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1083  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2742  hypothetical protein  58.42 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2232  protein of unknown function DUF1255  58.42 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2688  hypothetical protein  57.84 
 
 		 105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2828  protein of unknown function DUF1255  59.6 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2422  protein of unknown function DUF1255  59.6 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1403  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2552  hypothetical protein  57.58 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.271143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4775  hypothetical protein  55.67 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  54.9 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  54.9 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  119  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  54.9 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0281  hypothetical protein  50.98 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  53.92 
 
 		 103 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  50.98 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2102  hypothetical protein  51.96 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  51.96 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  48.04 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  46.08 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3372  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  43.14 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0146  hypothetical protein  45.19 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1752  hypothetical protein  48 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0748694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0064  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268417  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0059  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  42.16 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  44.12 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  39.22 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  45.54 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3424  hypothetical protein  36.27 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.310921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1472  hypothetical protein  48.15 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0489  hypothetical protein  39.56 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0862  hypothetical protein  40.66 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325253  normal  0.891406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0447  hypothetical protein  39.56 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.219742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0428  hypothetical protein  39.56 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0429  hypothetical protein  39.56 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.897795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0434  hypothetical protein  39.56 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0270  hypothetical protein  41.76 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44140  hypothetical protein  40.66 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2513  hypothetical protein  40.66 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195334  normal  0.450057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3754  hypothetical protein  39.56 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02857  hypothetical protein  40.22 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3668  hypothetical protein  37.78 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1831  hypothetical protein  40.66 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.860734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00338  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3217  protein of unknown function DUF1255  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00342  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0418  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3241  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436368  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0421  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0308  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29860  hypothetical protein  39.56 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.640265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0465  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2022  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4248  hypothetical protein  36.26 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1620  hypothetical protein  36.26 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3952  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3567  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000943  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.597764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2532  hypothetical protein  37.63 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2921  hypothetical protein  37.08 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3196  hypothetical protein  39.13 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310619  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06952  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  35.96 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  35.96 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3112  hypothetical protein  35.96 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3814  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0015  hypothetical protein  35.48 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2862  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0415789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1041  hypothetical protein  41.11 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1026  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.596759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>